Porto Rico ha anche i propri programmi di assicurazione sanitaria pubblica che coprono i residenti aventi diritto. Programmi finanziati dal governo come il Piano sanitario governativo (Mi Salud), forniscono copertura assicurativa sanitaria a individui e famiglie a basso reddito che soddisfano criteri di reddito e di ammissibilità.
Inoltre, il programma Medicaid (Medicaid de Puerto Rico) fornisce copertura sanitaria a determinati individui a basso reddito, donne incinte, bambini e persone disabili.
Inoltre, Porto Rico fa parte del programma Medicare degli Stati Uniti che fornisce copertura sanitaria ad anziani e disabili. I beneficiari di Medicare a Porto Rico possono accedere agli stessi vantaggi e servizi di quelli negli Stati Uniti.